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LncRNA控制造血干细胞功能
点击次数：194 发布时间：2015/4/14
研究小组确定了富集在小鼠造血干细胞（HSCs）中的159个未注释lncRNA（LncHSCs），其中两个lncRNA的敲除可影响HSC的自我更新和分化。
造血干细胞（HSCs）具有独特的基因表达程序，可执行干细胞的身份确定和调节细胞谱系定型。长非编码RNA（lncRNAs）已经成为基因表达和细胞命运决定的重要调节因子，然而它们在造血干细胞中的功能尚不清楚。
在这项研究中，研究人员通过深度测序描述了纯化造血干细胞的转录组，并鉴定了323个未加注释的lncRNAs。通过在已分化的细胞谱系中比较它们的表达，发现有159个lncRNAs富集在造血干细胞中，其中一些可能是HSC特异性的（lnchscs）。这些lncRNA基因与蛋白编码基因具有相同的表观遗传特征，包括通过DNA甲基化调控表达，敲除掉两个lncHSCs——lncHSC-1和lncHSC-2，对HSC自我更新和谱系决定具有不同的影响。
该研究小组精确找出了其中一个候选lncRNA的基因组结合位点，并发现了关键造血转录因子结合位点的富集，特别是E2A。总而言之，这些结果表明，lncRNAs对调节造血干细胞起着重要的作用，从而为控制HSC功能的遗传通路提供了更多的层面。
