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科学家生成人类全基因组中的增强子和启动子图集
研究人员生成了两个人类全基因组的基因调控子图集。两篇论文报道。篇是转录起始位点图集，即RNA聚合酶开始将DNA转录成RNA;第二篇是增强子激活图集，非启动子DNA的延伸上调某些基因的转录。
这是一个对不同细胞类型的转录子活性进行非常广泛的调查，是一个非常宝贵的资源，并且在目前来说，这也是相当独特，可比的资源是基因型与组织中的表达程序（ GTEX ） ，当大量收集有效转录数据的时候，特别是原代细胞。我觉得这是非常重要的。很多人会发现这数据是非常有用的。
人类基因组，并确定基因表达是如何产生那么多种细胞类型。参与DNA元件百科全书（ENCODE）计划的成员中，利用染色质免疫沉淀分析和DNA酶敏感区定位法，此外，为了确定转录因子结合DNA和染色质“开放”位点，因此用DNA酶进行切割。使用多种细胞系和只研究少数细胞类型，研究无数的原代细胞和组织类型，以及细胞系。
为了创建这些图谱，分析基因表达（ CAGE ）测序rna转录启动子。通过映射 CAGE 标签上的人类基因组，研究所领导的研究组鉴定出位于转录起始位点上游的启动子区域。研究人员使用CAGE 识别出人类原代细胞、组织样品和永生细胞系的启动子，他们发现，许多基因具有多个转录起始位点，并且在不同类型的细胞中转录起始的位置也不同。
采用CAGE ，研究组也确定了增强子的RNA转录序列。其他研究组先前表明，一些增强子是双向转录——从中心开始往外面两个方向转录，两条DNA链同时进行。研究小组发现的证据表明，双向转录是增强子激活的一个明显特征。CAGE检测出约75 %的增强子促进HeLa细胞中的报告基因表达，比以前通过ENCODE鉴定出非转录增强子的多。
在这么多类型的细胞，这一数字[增强子激活]是在一种低端领域中，其他组也发现，增强子生成RNA量非常低。我的理解是，他们同时拥有[一]高真阳性率，和假阴性率。所以，无论他们确定什么，我相信那些是真实的，激活的增强子，但它们也可能会错过激活的增强子，那是因为低丰度的eRNAs。
增强子和启动子的在未来的用途，定义到不同的细胞类型提高将一个细胞转化成另一个类型的细胞的可能性。它也可以帮助预测一个特定癌症是否要转移。
