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荧光定量数据分析准则
点击次数:946发布时间:2020/10/20
荧光定量数据分析准则
荧光定量是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,结合相应的软件可以对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度。
荧光定量PCR技术是通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时监控反应过程。随着PCR 反应的进行,反应产物不断累积,荧光信号强度也等比例增加。每经过一个循环,收集一次荧光强度信号,这样就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,结合相应的软件对产物进行分析,可以得到荧光扩增曲线,计算待测样品初始模版的量。实时荧光定量PCR技术是一次由定性技术向荧光定量定量技术的飞跃,运用该项技术,可以对DNA、RNA样品进行相对定量、绝对定量和定性分析。
判断数据的有效性,可以结合扩增曲线,溶解曲线,标准曲线以及NTC(检验引物)和NRC(检验模板)来分析。
1.扩增曲线应呈现出平滑的S型曲线,起始无扩增,起峰时间正常,由扩增曲线得到的Ct值是判断实验成功与否的重要参考,Ct值有一定的可信范围,临床检验小于33,科学研究小于38,内参基因一般小于20,且样品间内参的Ct值差不超过1,表明内参基因表达量稳定,复孔Ct值标准偏差不超过0.5;
2.溶解曲线应呈现单峰,峰的宽度较小,NTC和NRC无特异的峰出现;
3.标准曲线的斜率范围-3.58~-3.10,对应引物的扩增效率范围90%~110%,R2代表线性拟合度,一般大于0.95;
4.NTC用于判断反应是否存在模板污染,引物是否特异,是否会形成引物二聚体。NTC状况是没有扩增,即扩增曲线和溶5.解曲线与基线重合,没有Ct值。NTC有扩增的情况下,至少与加入模板体系的Ct值相差5或10以上;
6.NRC用于判断cDNA模板中是否存在基因组DNA残留,可以间接反映RNA中基因组DNA污染情况,理想情况下,NRC没有Ct值,有Ct值的话至少要跟加入cDNA模板体系的Ct值相差5或10以上。