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彗星实验(Comet assay)也被称为单细胞凝胶电泳实验(Single cell gel electrophoresis,SCGE),是种超灵敏的单细胞水平上检测DNA损伤的技术,可以检测到1.657×10-15中0.1个DNA的断裂,甚至检出自然光照射体外淋巴细胞1h后引起的DNA损伤。在电泳场下,损伤的细胞DNA(包含碎片和链断裂)从完整的DNA中分离出来,在显微镜下形成典型的“彗星尾巴”形状。DNA损伤的程度通常是通过测量彗星尾巴来目测的,也可以使用图像分析软件来测量各种参数。
Cell Biolabs【彗星分析应用域】:主要还是在细胞凋亡的研究,肿瘤/癌症研究,毒理学研究,环境污染监测,临床诊断与治疗监测。
接下来,艾美捷 Cell Biolabs会给大家分享下彗星分析实验(Comet assay)怎么做?
步:Cell Biolabs彗星分析试剂盒不可少(可根据实验用量,选择不同的规格:)
常用:Comet Assay Kits, 3-Well (3孔玻片)
高通量筛选:Comet Assay Kits, 96-Well(96孔玻片)
艾美捷 Cell Biolabs丨Comet Assay kit彗星分析试剂盒内提供了彗星分析所需的所有必需试剂,包括裂解液、彗星分析低熔点凝胶、DNA荧光染料、彗星分析玻片以及其它试剂。
第二步:彗星分析电泳模式选择:
电泳模式 检测类型 电泳时间 说明
TBE电泳(中性电泳)——检测单链和双链DNA的断裂——推荐10-15 mins——分析细胞凋亡的shou选方法,可使用尾巴长度而非尾矩进行数据分析。
碱性电泳——检测单链和双链DNA的断裂,AP位点损伤在内的所有DNA 损伤——推荐15-30mins——灵敏度zui高!
* 实验过程中的各类缓冲液都需要4℃预冷。
关于电泳电压:以上2种电泳模式,均推荐参考实验室电泳槽两J间的举例,按照1V/cm的标准设置电压。举例,如果电泳槽两J举例是35cm,那么你需要使用35V的电压来执行电泳。
实验环境:为避免紫外线对细胞样品造成额外损害,请在弱光条件下进行。
第三步:彗星分析的典型结果样式
如上图,左侧是健康的Jurkat细胞(未处理);右侧是使用20 uM Eoside(依托泊苷)处理4小时的Jurkat细胞。【电泳条件:碱性电泳,15mins】
第四步:彗星分析结果计算
通过测量细胞核遗传物质(“彗头”)与产生的“尾巴”之间的位移,可以量化DNA损伤。 尾矩(Tail Moment)和尾巴DNA%(Tail DNA% )是分析彗星分析结果的两个常见的参数。 每个样品至少应分析50 -100个细胞。考虑到遗传物质的迁移以及尾巴中DNA的相对数量,通常建议使用尾矩作为评估DNA损伤的指标。
Cell Biolabs 配套彗星实验结果分析软件:
软件名称 说明
OpenComet 免费;是Image J软件的款彗星分析插件
CaspLab (CASP) 免费;独立软件
Comet Assay IV 付费软件;可试用1周
艾美捷科技是Cell Biolabs的中国代理商,为科研工作者提供优质的彗星分析试剂盒。