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技术文章

当心!出现这些现象,你的实验可能存在核酸污染!(2)

点击次数:8 发布时间:2024/12/2 9:32:16

聚合酶链反应(PCR)实验是分子生物学领域中的一项核心技术,用于扩增特定的DNA或RNA 片段。然而,由于其高度敏感性,PCR实验极易受到各种形式的污染,特别是核酸污染。核酸污染不仅会影响实验结果的准确性,还可能误导后续的研究和分析。因此,在进行PCR实验时,必须高度警惕可能出现的核酸污染迹象,并采取相应的应对措施。

一、需警惕的核酸污染迹象

  1. 非特异性扩增
    非特异性扩增是PCR实验中常见的污染迹象。当实验中出现与预期目标片段不符的扩增产物时,可能是由于环境中存在的其他核酸片段被错误地扩增。这种非特异性扩增往往会导致实验结果的复杂性和不确定性增加。

  2. 假阳性结果
    假阳性结果是另一个需要警惕的污染迹象。即使样本本身不含有目标核酸,如果实验环境中存在微量的核酸污染,也可能导致扩增反应的发生,从而产生假阳性结果。这种结果不仅浪费实验资源,还可能对后续的研究产生误导。

  3. 实验重复性差
    如果PCR实验的重复性较差,即相同条件下多次实验的结果不一致,那么很可能是受到了核酸污染的影响。污染物的存在会干扰扩增反应的正常进行,导致实验结果的稳定性和可靠性降低。

  4. 扩增效率低下
    当实验中的扩增效率低下时,也需要警惕是否存在核酸污染。污染物的存在可能会与目标核酸竞争反应资源,如引物、酶和底物等,从而降低扩增效率。

二、可能的核酸污染来源

  1. 样本污染
    样本在采集、处理或储存过程中可能受到污染。例如,收集样本的容器被污染,或样本密封不严导致外溢等。

  2. 试剂污染
    试剂在制备、储存和使用过程中也可能受到污染。如果试剂被污染,那么整个实验过程都可能受到影响。

  3. 气溶胶污染
    气溶胶是PCR实验中一种常见的污染源。在操作过程中,如开盖、吸样等,都可能产生气溶胶并导致污染。特别是在使用高浓度的PCR产物时,气溶胶污染的风险更高。

  4. 设备污染
    实验设备如移液器、离心机等在使用后未及时清洁和消毒,也可能成为污染源。

三、应对策略

  1. 严格实验室管理
    实验室应建立完善的管理制度和操作规程,确保实验环境的清洁和整洁。同时,应定期对实验室进行清洁和消毒,以减少污染物的存在。

  2. 规范实验操作
    操作人员应严格遵守实验操作规程,避免不必要的污染。例如,在操作过程中应使用带滤芯的枪头,避免阳性样本污染枪头;在打开反应管前应瞬时离心,以降低污染手套或加样器的风险。

  3. 使用专用试剂和耗材
    试剂和耗材应存放在专用的储存柜中,避免与污染源接触。同时,应使用高质量的试剂和耗材,以减少污染的可能性。

  4. 加强实验监测
    在实验过程中应定期监测污染情况,如使用特定的指示剂或标记物来检测污染物的存在。一旦发现污染迹象,应立即停止实验并采取相应的处理措施。

  5. 采用预防污染技术
    随着科技的不断进步,一些先 进的防污染技术如UNG/UDG酶处理、气溶胶过滤等已被广泛应用于PCR实验中。以德国MB公司生产的PCR Clean?为例,该产品是即用型喷雾产品,直接与污染物相作用,清除核酸污染。

 

PCR实验中的核酸污染是一个不容忽视的问题。为了获得准确可靠的实验结果,我们必须高度警惕可能出现的污染迹象,并采取相应的应对措施。通过严格的实验室管理、规范的操作规程、高质量的试剂和耗材以及先 进的防污染技术,我们可以降低污染的风险并提高实验的准确性和可靠性。这将为后续的研究和分析提供有力的支持。


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原创作者:北京缔一生物科技有限公司

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