核酸分子大小与琼脂糖浓度的关系

（1）DNA分子的大小 在凝胶中，DNA片段迁移距离（迁移率）与碱基对的对数成反比，因此通过已知大小的标准物移动的距离与未知片段的移动距离时行比较，便可测出未知片段的大小。但是当DNA分子大小超过20kb时，普通琼脂糖凝胶就很难将它们分开。此时电泳的迁移率不再依赖于分子大小，因此，就用琼脂糖凝胶电泳分离DNA时，分子大小不宜超过此值。

（2）琼脂脂糖的浓度 如下所示，不同大小的DNA需要用不同浓度的琼脂糖凝胶进行电泳分离。

琼脂糖浓度与DNA分离范围

琼脂糖浓度 /% 0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 2.0

线状DNA大小/kb60-520-110-0.87-0.56-0.44-0.23-0.1

如何选择琼脂糖凝胶的浓度来分离DNA

总体原则是：分子量大的DNA，电泳时使用浓度较小的凝胶反之亦反。胶浓度越大，电泳速度越小；若胶浓度偏高，可能跑不动，条带缩在一起；若胶浓度过低，可能跑得太快，同样分不开。可参考下面的对应关系：

凝胶浓度（%） 线性DNA长度（bp）

0.5 1000～30000

0.7 800～12000

1.0 500～10000

1.2 400～7000

1.5 200～3000

2.0 50～2000