细菌在适宜的条件下，适合生长的固体培养基表面或内部，经过一定时间的培养，分裂繁殖出巨大数量的菌体，形成一个肉眼可见，有一定形态的独立群体，称为菌落。


病毒，将10倍梯度稀释的病毒样本接种吸附于单层细胞，然后覆盖一层含有营养液的琼脂，经过一段时间的培养，染色，原先感染病毒的细胞及病毒扩散的周围细胞会形成一个近似圆形的斑点，类似固体培养基上的菌落形态，称为空斑。但是，空斑技术是纯化和滴定病毒的，不用来鉴别。


细菌，不同菌的菌落在大小，色泽，质地，表面性状，边缘结构等方面均有各自的特征，同一种菌在不同的培养基上的菌落形态也会不尽相同，同一种菌在同一个培养基上也有可能长出不同形态的菌落。比如大肠杆菌，在麦康凯琼脂上是红色菌落，在伊红美蓝琼脂上是黑色带金属闪光的菌落。再比如炭疽杆菌，在普通培养基中，强毒菌株是粗糙型菌落，无毒或弱毒菌株是光滑型菌落。


霉菌，是在营养基质上，形成绒毛状，蛛网状或絮状菌丝体的一种真菌。


放线菌，是能形成分枝菌丝的细菌，菌落由有隔或无隔菌丝组成。比如牛放线菌，在血琼脂上，37度厌氧培养2天，可见半透明，乳白色，不溶血的粗糙菌落。


酵母菌，大多数为单细胞的一类真菌。一般看细胞结构。补充，霉菌，酵母菌是形态群的俗称，不是分类学名称。