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分享遗传学新技术

点击次数:950发布时间:2018/4/13

理解染色质修饰在发育和疾病中的调控作用是非常重要的,不过这样的研究往往会受到样本量的限制。基于染色质免疫共沉淀的深度测序(ChIP-seq)近来在这一领域取得了一定进展,但要实现高质量的图谱分析还面临着不少挑战。

研究人员开发了两项新技术,RP-ChIP-seq(recovery via protection -ChIP-seq)和FARP-ChIP-seq(favored amplification RP-ChIP-seq)。这两项技术只需500个细胞就能进行可靠的表观基因组分析。

研究显示,RP-ChIP-seq可以在一个小鼠晶状体中检测衰老相关的表观遗传学改变。而FARP-ChIP-seq能够在小鼠的长期造血干细胞(long-term HSC)、短期造血干细胞(short-term HSC)和多能前体细胞(MPP)准确地同时定位组蛋白修饰H3K4me3和H3K27me3。

在细胞分化过程中,H3K4me3/H3K27me3双修饰的二价状态,会变成H3K4me3或者H3K27me3单修饰状态,进而调控基因的表达情况。这项研究表明,HSC中的造血分化基因缺乏H3K4me3/H3K27me3二价状态。

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