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了解天然多肽化合物的生物合成机制

点击次数:991发布时间:2018/5/7

 由细菌或真菌通过自身代谢合成的天然多肽化合物,例如青霉素、环孢素、棘白霉素类化合物等,许多都具有抗菌或抗肿瘤活性,是国内外新药创制的重要源泉。它们的生物合成途径分为两类,一类通过核糖体来源的多肽进行缩合、修饰及环合,另一类则通过一种具有高度模块化特征的非核糖体多肽合酶(NRPS)将天然或非天然的氨基酸逐一组装起来,这种工作机制兼具高效性和灵活的特异性,保证了天然多肽产物结构的多样性。对细菌和真菌非核糖体多肽合酶的组装、结构和催化机制研究,有助于深入了解天然多肽化合物的生物合成机制,并使通过组合生物合成手段获得更多有生物活性的多肽化合物成为可能。

早期的研究表明:细菌来源的NRPS途径链状多肽产物的释放与环合是通过硫酯酶(thioesterase, TE)完成的,而真菌NRPS则经常由一个类似于缩合结合域的功能域(CT功能域)来控制多肽产物生物合成的终止与环合。为了从分子机制上阐明CT功能域如何在控制真菌NRPS生物合成终止过程中发挥作用,中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室的周佳海研究团队分别解析了CT功能域(1.8埃分辨率)和处于活化状态的T-CT复合物(2.49埃分辨率)的晶体结构,发现经典缩合结构域的一段N端环状区域被CT功能域相应的α1螺旋所取代,并导致α2螺旋向活性口袋邻近的接纳位点靠近(见下图),从而阻滞了与T功能域相连的底物上载到接纳位点上进行新一轮的肽基延伸反应。

T-CT复合物晶体结构揭示一旦T功能域被活化后,磷酸泛酰巯基将参与稳定T与CT的相互作用,并从CT功能域活性口袋的一侧接纳线状多肽产物,完成*终环状多肽产物的合成与释放。这不仅解释了真菌NRPS中CT功能域为何必须依赖T功能域才发挥作用,也为通过合理设计来产生不同大小与结构的新型大环多肽天然产物提供了技术蓝图。

19600-63-61,2-环氧-7-辛烯英文名称:CAS号:1,2-EPOXY-7-OCTENE
285-67-61,2-环氧环戊烯英文名称:CAS号:Cyclopentene oxide
50418-68-31,2-环氧辛烷英文名称:CAS号:(S)-1,2-EPOXYOCTANE
521-24-41,2-萘醌-4-磺酸钠;β-萘醌-4-磺酸钠英文名称:CAS号:1,2-Naphthoqui-4-sulfonic acid sodiuM salt;SodiuM 1,2-naphthoqui-4-sulfonate;β-Naphthoqui-4-sulfonic acid sodiuM salt;3,4-Dihydro-3,4-dioxo-1-naphthalene sulfonic acid sodiuM salt
6920-24-71,2-十六烷二醇英文名称:CAS号:1,2-HEXADECANEDIOL
85233-19-81,2-双(2-氨基苯氧基)乙烷-N,N,N',N'-四乙酸英文名称:CAS号:BAPTA
540-63-61,2-乙二硫醇;二硫代乙二醇;1,2-二巯基乙烷;1,2-乙烷二硫醇英文名称:CAS号:1, 2-Ethanedithiol;Dithioglycol;1,2-DiMercaptoethane;Dithioethyleneglycol;Ethylene Mercaptan;Ethylone diMercaptan
181058-08-21,3,5-三(溴甲基)-2,4,6-三乙基苯 98%英文名称:CAS号:1,3,5-TRIS(BROMOMETHYL)-2,4,6-TRIETHYLBENZENE
621-23-81,3,5-三甲氧基苯, 99%英文名称:CAS号:1,3,5-Trimethoxybenzene
108-78-11,3,5-三嗪-2,4,6-三胺英文名称:CAS号:Melamine
 

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