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公司新闻
细胞遗传学的发展前景
点击次数：1620发布时间：2018/11/19
细胞遗传学意在确定一个基因组中与众不同的结构特征。这说起来容易，做起来难。多年来，研究人员手头的工具很有限，只有吉姆萨染色、FISH和DNA芯片。新兴的DNA测序技术将细胞遗传学的分辨率提高到前所未有的水平，缩小了分子细胞遗传学和分子遗传学之间的距离。
然而，测序，想说爱你不容易。测序读长仍然太短，难以直接回答细胞遗传学的问题。当然，新的策略在不断开发中。在此，我们展望一下基因组测序在发现染色体结构变异（CV）上的前景，尽管有些区域目前仍无法解析，但随着技术的发展和进步，终究会突破。
吉姆萨染色、核型分析等技术适合观察Mb规模的染色体畸变，如非整倍体和大的重排，这可在显微镜下观察到。利用荧光原位杂交（FISH）技术，研究人员可检测到低至500 kb的结构差异。
DNA芯片的引入实现了拷贝数变异和染色体结构变化的检测，其分辨率低至5-10 kb。不过它们并不能提 供重复拷贝的位置信息。它们也不能检测平衡易位。或许更重要的是，芯片在高度重复的序列上表现不太好，因而无法分辨异常序列的断裂点。
我们还有另一个选择，新一代测序（NGS）。据Illumina公司生殖与优生健康的市场部Rich Shippy介绍，NGS可检测所有的畸变类型，包括平衡易位、倒位和序列水平的变异。他认为，与芯片相比，NGS能更加精确地定位CNV，达到近乎单核苷酸的分辨率。
当然，更长read的zui终目标是从头开始构建出一个基因组。毕竟，这才是分子细胞遗传学家所追求的，基因组结构的准确描述。Eichler认为：“这是此领域的圣杯：如果你拿到一个基因组，测序，并无需任何指导将其准确组装，那么你就大功告成了。所有的分子细胞遗传学家将失去工作。你会了解所有的倒位、缺失和重复。"
这一天可能不会太遥远。在上个月召开的基因组生物学技术进展大会（AGBT）上，Pacific Biosciences宣布了*只利用PacBio read的de novo人类基因组组装。利用平均读长为7,700 bp的reads，他们组装了54x的基因组，据介绍，读长将在一年之内达到20,000 bp。当这一切实现时，细胞遗传学的答案可能唾手可得。
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