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公司新闻
人原始生殖细胞的转录组和 DNA 甲基化谱高分析
点击次数：678发布时间：2021/4/12
生殖细胞对于将遗传信息从代传递到下代以及维持物种的延续至关重要。在这里，作者在单细胞和单碱基分辨率下分析了人类原始生殖细胞（PGCs）从迁移阶段到性腺阶段的转录组。人 PGC 显示独特的转录模式，涉及多能性基因和种系特异性基因的同时表达，其中部分显示发育阶段特异性特征。此外，还同时分析了人类 PGCs 的 DNA 甲基化组，并发现其基因组的整体去甲基化。妊娠后大约 10 至 11 周，PGC 几乎没有任何 DNA 甲基化发生，男性和女性 PGC 中平均甲基化水平仅分别为 7.8% 和 6.0%。
人原始生殖细胞的转录组和 DNA 甲基化谱高分析：
1、T-sne降维算法展示胞分组情况。
2、启动子区所有位点高低甲基化展示(散点图)。
3、特定基因CG位的位点甲基化程度属示(差异展示)。
4、関图属示不同样本甲基化程度在所有染色体上的甲基化分布。
5、所有基因不同功能区域的甲基化走势分析。
6、CGI上下游功能区域的甲基化走势分析。
7、特定基因的甲基化走势分析。
8、 Methyle&RNA的整体联合分析(热图、点图）。
9、基于甲基化数的 K-means聚类。
10基于甲基化数据的 WGCNA分析。
11、基于甲基化数的IPA分析。
大鼠主动脉平滑肌细胞Rat aortic smooth muscle cells
HUVEC, 人脐静脉内皮细胞HUVEC, human umbilical vein endothelial cells
人脐动脉内皮细胞Human umbilical artery endothelial cells
人脐静脉平滑肌细胞Human umbilical vein smooth muscle cells
人脐动脉平滑肌细胞Human umbilical artery smooth muscle cells
人脐带血单个核细胞Human umbilical cord blood mononuclear cells
小鼠骨髓间充质干细胞（EGFP标记）Mouse bone marrow mesenchymal stem cells (EGFP mark)
人骨髓间充质干细胞（hMSCs）Human bone marrow mesenchymal stem cells (hMSCs)
人间充质干细胞-脂肪Human mesenchymal stem cells - fat
人间充质干细胞-肝Human mesenchymal stem cell of liver
人间充质干细胞-脐带Human umbilical cord mesenchymal stem cell
小鼠神经干细胞Mouse neural stem cells
小鼠海马神经胶质细胞（EGFP标记）Mouse hippocampal glial cells (EGFP mark)
小鼠皮层神经胶质细胞（EGFP标记）Mouse cortical glial cells (EGFP mark)
小鼠神经干细胞（EGFP标记）Mouse neural stem cells (EGFP mark)
人脑微血管内皮细胞Human brain microvascular endothelial cells
人脑血管平滑肌细胞Human brain vascular smooth muscle cells
人海马神经元Hippocampal neurons
人少突胶质细胞Oligodendrocytes
人星形胶质细胞Astrocytes
小鼠成纤维细胞（EGFP标记）Mouse fibroblasts (EGFP mark)
mCF, 小鼠心脏成纤维细胞MCF, mouse cardiac fibroblasts
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