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细胞捕获的技术方法
点击次数:235 发布时间:2018/9/10
在细胞分析中,我们往往采用细胞群体,来获取某个参数的平均值。然而,随着细胞生物学的发展,我们逐渐意识到,平均值已不再能满足我们的要求。对于一些复杂的组织,群体性研究只能获得某些数量上占优势的细胞信息,比如高度异质性的实体瘤组织。同时,还有一些细胞的量极少,如产前诊断中的胎儿细胞或循环肿瘤细胞。当然,别忘了自然界还存在各种各样的微生物。其中,大部分微生物不仅数量有限,也无法用传统的方法扩大培养。对于这些微量细胞的分析,常规的技术显然束手无策。
近年来,流式细胞分选和激光捕获显微切割技术的出现让单细胞的捕获成为可能。不过,在获得目的细胞之后,如何与下游分析技术(如新一代测序和芯片)衔接呢?单个细胞只含有pg级的DNA,细菌更是只有fg级的DNA,但测序或芯片分析通常需要μg甚至mg级的DNA。怎么办?让全基因组扩增来帮忙!
全基因组扩增(whole gemome amplification)是对全部基因组序列进行非选择性扩增的技术,其目的是在没有序列偏向性的前提下大幅度增加DNA的总量。之前人们常用基于PCR的扩增方法(如DOP-PCR和PEP-PCR),但这些方法不能对各个片段进行均匀地扩增,有可能产生扩增假象。因此,目前人们多采用多重置换扩增(MDA)方法。
号称基因组复印机的QIAGEN REPLI-g试剂盒正是基于多重置换扩增技术,对有限的样品进行快速、均匀、无偏向的等温全基因组扩增,从而获得更多遗传信息。