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NuSmart®在FFPE(福尔马林固定石蜡包埋)鉴定中应用

点击次数:11 发布时间:2024/9/4 9:27:54

NuSmart®FFPE(福尔马林固定石蜡包埋)鉴定中应用

——无需脱蜡、一片即结果

 

FFPE是"福尔马林固定、石蜡包埋"(Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded)的缩写,是一种常见的组织样本保存方法。在医学研究和临床诊断中,FFPE可用于组织学检查、病理诊断和分子分析。而FFPE在分子分析中的应用主要包括:

1、癌症研究FFPE样本常用于癌症基因组学研究,包括突变分析、拷贝数变异检测等。

2、基因表达分析:FFPE样本中的RNA可用于基因表达分析,了解疾病相关基因的表达模式。

3、DNA甲基化分析:FFPE样本可用于研究DNA甲基化状态,探索与疾病相关的表观遗传学改变。

4、miRNA分析:FFPE样本中的miRNA可用于研究其在疾病发生发展中的作用。

5、生物银行和历史样本研究:利用存储的历史FFPE样本进行生物标志物的发现和验证研究。

愿望是美好的,现实是提取FFPE中DNA存在很多“痛处”,例如

1、DNA损伤和化学修饰:福尔马林固定导致DNA发生化学修饰,如碱基脱嘌呤、链间交联等。

2、DNApian段化:FFPE样本中的DNA通常已部分降解,形成较小的片段,这可能影响某些需要较长DNA片段的实验。

3、DNA与蛋白质的交联:DNA可能与组蛋白等蛋白质紧密交联,增加了提取和纯化的难度。

4、样品质量控制:组织脱水、固定延迟或时间过长等因素都会损害标本质量。

5、DNA提取效率:目市场的FFPE提取试剂盒性能差异很大,提取时间和提取效率都有很大不同。

6、PCR抑制剂:FFPE样本中可能存在PCR抑制剂,影响后续的PCR扩增反应。

NuSmart®技术wan美解决以上痛点,NuSmart®FFPE样本PCR试剂盒提供了FFPE Buffer用于将切片中组织DNA释放出来,高耐受力的2× FFPE Smart Mix能够抑制常见干扰剂。总结来看有以下特点:

—1-2片切片就有结果

—操作简单,无需脱蜡

—操作便捷,仅需要10分钟

—仅需要加热处理

—无需配备昂贵设备

 

操作流程

 

 

 

案例 不同组织切片扩增8对引物

 

1、肝 2、肺 3、胃

 

使用NuSmart®FFPE样本PCR试剂盒(货号Nu-FFPE0101)处理肝、肺、胃三组切片,使用2× FFPE Smart Mix8对引物

 

 

 

 

 

 

原创作者:上海创凌生物科技有限公司

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