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单细胞蛋白质组学

点击次数:16发布时间:2023/8/1 17:54:59

  单细胞蛋白质组学

更新日期:2023/8/1 17:54:59

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简单介绍:   单细胞蛋白质组学基于CE-MS的单细胞分析应用主要集中在大体积细胞的蛋白质组研究上,其实验流程与常规的蛋白质组学基本一致。利用比单细胞尺寸更小的毛细管管径对亚细胞区域进行内容物的提取以

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   单细胞蛋白质组学基于CE-MS的单细胞分析应用主要集中在大体积细胞的蛋白质组研究上,其实验流程与常规的蛋白质组学基本一致。利用比单细胞尺寸更小的毛细管管径对亚细胞区域进行内容物的提取以及转移,是毛细管应用的一大特色。但CE与质谱接口的稳定性不足、CE方法重复性略差、电泳分离过程受pH值和温度等因素的影响,以及蛋白酶解物在电泳过程中的吸附造成样本损失等问题的存在,限制了CE-MS在单细胞蛋白质组学中的进一步应用。
  对细胞的精确认知是理解细胞在生理和病理过程中功能的先决条件。传统研究手段是针对细胞群体进行分析,获得大量细胞的平均化结果,无法区分不同细胞个体对于样品异质性的精确贡献值,从而忽视或掩盖了单细胞的个体差异。单细胞蛋白质组学不仅可以提供单个细胞的基因表达情况,为细胞亚群分类提供大数据参考,而且可以通过蛋白质层面的检测,避免转录后调控以及翻译后调控带来的表达水平改变,更加接近细胞的调控本质,能够更加深刻和准确理解疾病的根本原因,在肿瘤、免疫以及生殖发育领域都具有极大的研究价值,为揭示生理病理表型、药物靶点的开发、及实现精准医疗都提供了数据参考。
  单细胞内蛋白质种类繁多,丰度低,动态分布范围宽且无法扩增,因此对检测手段提出了更高的灵敏度要求。在众多高灵敏分析方法中,荧光检测方法的灵敏度可以达到单分子水平,并且具有动态跟踪能力,但是其蛋白质检测通量有限。然而电化学检测方法虽然细胞干扰小,但受限于蛋白质通量以及电化学活性的要求,无法对多种蛋白质进行同时检测。质谱作为研究蛋白质组学的一种常规方法,其灵敏度高,通过已有的蛋白质数据库,可以同时对上万种蛋白质进行定性以及定量,并且可以提供丰富的蛋白质结构信息。但是由于单个体细胞内的蛋白质总量平均只有约100pg,利用质谱直接进行检测会面临样本复杂度和单细胞灵敏度等挑战,因此质谱前的分离技术对于提高方法检测灵敏度以及蛋白质定性定量的准确度来说十分必要。
  细胞是构成生物体的基本单位,由于遗传因素、生化噪音、细胞微环境等诸多因素使得单个细胞之间存在着广泛的异质性。因此,单细胞研究不仅可使人类对细胞与生命的本质有更为精确的认识,同时也为疾病的诊断、分型、治疗以及预后提供了更为强有力的工具。蛋白质作为生命活动的主要承担者,可以为其提供更为直接且更有价值的表型信息,因此成为单细胞研究的热点目标。
  毛细管电泳因其成本较低,分析速度快、分离效率高,已广泛应用于复杂生物样本的分离分析。CE具有nL级进样量,可直接在细胞或组织中进行微区取样,从而避免基质干扰、氧化损伤等,与少量细胞或者少量蛋白酶解液的分析相比,对单个细胞中内源蛋白质的分析更能反映细胞的状态和功能。人们首先尝试在较大的单细胞中利用CE-MS进行内源蛋白质的分析。毛细管由于内径小于囊胚细胞的大小,因此在光学显微镜的指导下,可以利用毛细管对细胞胚胎特定区域进行采样,取样速度不仅更快,也提高了空间分辨率。
  单细胞蛋白质组学应用方向
  1、异质性研究:单细胞蛋白组学可用于复杂样本(肿瘤、免疫、神经样本)研究,细分细胞亚群、区分细胞状态、研究细胞发育等
  2、稀有细胞研究:单细胞蛋白组学精细的技术可实现对数量稀少但至关重要的稀有细胞(生殖细胞、循环肿瘤细胞、干细胞)进行深度分析
  单细胞蛋白质组学服务技术优势
  成功率高:单细胞精准捕获,成功率达到90%以上
  超高能力:单个细胞鉴定数量达1500+
  便捷无忧:单细胞分选与蛋白组学一站式服务

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