德Febit Geniom miRNA生物芯片

产品介绍

人类基因组项目(Human Genome Project)完成以后，摆在我们面的挑战就是如何来解码这些浩瀚的基因信息，研究基因如何来维持正常的细胞功能，以及变异如何导致疾*病的发生，从而为人类的健康服务。

 

德Febit公司是上唯家以提供技术、产品和服务，来有效地解读生命密码的全*方*位生物技术公司。基于其核心的Genion技术，Febit开发了集仪器、耗材、服务于体的独特组合，在快速发展的基因组学及翻译调控研究域，是您理想的技术合作伙伴。 Febit新组合：仪器、生物信息学、预制或者定做的微流体生物芯片，以及独*创的芯片上标记技术，为全自动微阵列处理及数据分析创造了平台。

 

Geniom生物芯片

 

微流生物芯片，对重复性杂交及洗涤环境有着精*确的流体控制

 

封闭的间隔消*除了蒸发，并提供了高温杂交环境

 

8个分开的微通道，每个含15,624阵点

 

每张芯片含124,992阵点

 

可以平行地进行8个样本的杂交检测

 

miRNA芯片服务

 

mRNA表达谱

 

至，在际顶期刊上，已有很多利用Febit的Geniom表达谱芯片技术发表的高水平文章。

 

miRNA芯片服务

MicroRNAs(miRNAs)是种内源性非编码RNA，在基因调节中起着重要作用，在许多生命过

程中也发挥着重要作用。MicroRNAs（miRNAs）的产生和成熟需要系列因子的参与。早

从基因中转录出的是miRNA转录本（pri- miRNAs）,被RNase III剪接加工生成70至100个核苷酸的发夹体（Pre-miRNAs）。然后从细胞核转移到细胞质中，Pre-miRNAs然后被另

个类似于RNase III的Dicer酶加工，生成长度平均为21-23nt的成熟miRNAs。

成熟的MiRNA与RNA干扰（RNAi）效应复合体，RISC结合，通过改变靶标mRNA的稳定性或翻

译效率，而直接起到转录后抑制作用。

 

近的研究表明，miRNAs与人类肿*瘤发育相关，意味着它们代表了癌症及其它疾*病大有

途的类新型生物标记。鉴定些特殊癌症相关的miRNAs将可以提供有用的诊断信息，有

助于疾*病分类，并找到潜在的处理办法。 

个单独的生物标记往往在特异性及灵敏度方面受限，为了将miRNA作为诊断标记，有必要进行多重分析。而miRNA表达谱就能作为高度特异且信息丰富的生物标记工具，来完成该项工作。miRNA芯片的应用将能够区分单个miRNA，并以高度精*确性完成miRNA标签信息的收集。

 

芯片特点：核心技术是微流体Geniom生物芯片所检测的miRNA数量全，和Sanger miRBase 14.0版同步。服务可以检测出数据库中所有的microRNA。 

 

2009年9月15日，Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升至14.0版。新增1580条miR序列，至此miRBase中的microRNA 序列信息已超过10,000条。14.0版本共收录10,581条成熟miRNA序列信息，通过验证的microRNA发夹体从9,539条增至10,883条，共涵盖115个物种。

除此之外，14.0版miRBase第|次报道了10个物种的microRNA信息，它们是：Equus caballus (野马)，Daphnia pulex (蚤状溞)，Phaseolus vulgaris (菜豆)，Malus domestica (苹果)，Brachypodium distachyon (二穗短柄草)，Aquilegia coerulea (洛矶山耧斗菜)，Populus euphratica (胡杨)，Herpes B virus (乙型疱疹病毒)， Infectious laryngotracheitis virus (传染性喉气管炎病毒)，Herpesvirus of turkeys (火鸡疱疹病毒)。

 

有效和优化的探针设计。因此，任miRNA生物标记会也不会从检测过程中漏掉

 

快速服务，从提交样本到出实验结果仅2－3周

 

样本量要求少，标准只需1－2ug总RNA，少需要130ng总RNA

 

灵活快速地定制生物芯片，包括预期的，突变，或者特殊要求的miRNA序列

 

Geniom RT分析仪融入了自动化微阵列处理的高精度的微流体技术，使得分析正实现了全自动化。统的杂交环境促使了结果的高重现性以及检测的快速性。自动流程包括：自动化样本装载，动态的温度控制，低体积的主动运动杂交（20ul），自动洗涤，自动动态成象，以及数据分析

 

完整的服务,从样本到即可用于发表的数据，实现条龙服务

 

完整数据分析及易懂的生物信息学报告

 

单个miRNA及miRNA表达谱的高精*确测定

 

卓*越的阵列批次间重现性

 

在中microRNA芯片市场上，性价比高

 

另外，我们还提供全程miRNA表达谱服务,例如项目启动咨询。

 

microRNA芯片标准报告内容（Standard analysis report）

 

1. Raw data in Excel format

2. Properties of raw data

3. Spatial distribution of raw data

4. Normalization of background corrected raw data

5. Correlation Analysis

6. Scatter Plots

7. Cluster analysis

8. Present calls analysis

9. Venn Diagrams

10. MA Plots

11. Principal Component Analysis

12. Variance-related Boxplots

13. Detection of differentially expressed miRNAs

14. Targets of de-miRNAs(deregulated miRNAs)

15. Targets of de-miRNAs

16. Motif search of de-miRNAs

17. Pairwise alignments of de-miRNAs

 

为正常和癌症组织miRNA的聚类分析结果：

 

 除了常规杂交方法，Febit特有的miRNA芯片上即时酶标技术(MPEA),可以显著提高检测灵敏度

 

微流引物延伸（MPEA，Microfluidic Primer Extension Assay)是指miRNA样本在和芯片上的引物杂交，不需要标记，接着，DNA聚合酶I的大片段直接加入微量流动芯片的通道中，相应的miRNA得以特异延伸。此方法将杂交的特异性与酶延伸的差异高辨别能力结合，大大提高了灵敏度和降低了所需样本量。无需扩增，就可以检测出纳克的总RNA。尤其是对样本量少的检测，例如福尔马林固定样本，组织针孔吸取样本，激光捕获显微分离样本。微量流动引物扩增检验（MPEA）相对于其它微阵列miRNA表达谱，显示了其突出优势。相比于传统的杂交检测，MPEA提供了更高水平的灵敏度，酶催化的延伸仅在3’末端几乎完*全配对时才会发生，因此很少会出现交叉杂交信号。MPEA进步增强了miRNA杂交灵敏度，以确保高识别能力。miRNA生物标记即使与miRNA家族成员有很高的同源性也能被准确无误地识别。

 

Hsa-let-7 miRNA家族分析,明*显降*低了交叉杂交，增强了检测可信度，即使单个碱基的错配也能识别。

 

Small Molecules with Big Impact in Cancer

 

Impact of MicroRNAs in Cancer Research

 

Microfluidic-based enzymatic on-chip labeling of miRNAs

 

MiRNA表达谱——肿*瘤的生物标记物

 

mRNA基因表达谱：从单信号通道特异性表达标签到基因组范围内的基因活性检测

 

转录组(Transcriptome)是指细胞或组织中mRNA在发育过程中某个特定时间内转录情况的整体表现。在生物体系中，它在基因和疾*病的信息交流中起着关键的纽带作用。因此，识别能引发疾*病反应的基因表达变化，能加深我们对常见功能失调的理解。 

从通路特异基因表达标签到基因组范围内基因活性鉴定，微阵列都是mRNA表达分析的强有力工具。当应用于疾*病及正常状况样本时，基于微阵列的表达谱可以区分出差异表达的基因，因此在疾*病的发生和发展中起着重要作用。微阵列顺应了疾*病诊断冶疗多元化检验的发展需求，有助于提高疾*病分期、风险分层以及冶疗决策。此外，RNA表达谱在其它研究域也起着重要作用，如发育生物学、干细胞研究、以及微生物学。

应对现代基因组学研究的需求，Febit提供了系列预制的Geniom生物芯片，门针对不同的生物及分子通路。除此之外，根据客户的实验需求，轻松设计并快速制作特殊的芯片。另外，Geniom生物芯片可以用于内含子区域及长的非编码RNA转录分析，因此和转录组学域的发展达到同步。

 

Febit提供的全程RNA表达谱服务：

 

针对所有生物预制的系列Geniom生物芯片

 

针对特殊RNA表达分析，灵活定制芯片，即刻适应新的序列信息

 

标准生物芯片用于通路及500多个基因组研究

 

特殊疾*病，信号通路，及器官中基因活性研究

 

基于任*何生物的新的基因数据库，快速灵活地设计探针

 

样本量需求少： 

核生物：标准1－2ug总RNA，小需要500ng总RNA 

原核生物：只需要3ug总RNA

 

从提交样本2－3周的时间内，便能得到综合分析报告

 

无*论什么样本来源，均有可信的、精*确的基因表达谱

 

卓*越的阵列对阵列的重现性

 

综合数据分析及易懂的生物信息学报告

 

通过验证的阵列可用于任*何模式生物及其它生物 

不管你的实验是集中于人类医学或典型的模式生物分析如小鼠或果蝇，还是研究特殊的原核生物，Geniom 生物芯片均能提供任*何物种的RNA表达谱。Febit提供了预制的微阵列完整清单供挑选。它包括了原核及核全基因组表达阵列、信号转导途径以及miRNA靶基因生物芯片。该芯片的灵活运用和卓*越的结果可重现性将保证您实验得到满意的回复。

 

烟曲霉mRNA表达谱分析 

检测了8个样本及4种不同环境。左图中重复的散点以及右图中相应的矩阵显示出基因表达谱

结果好的重复性。重复相关性为0.985。