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CBV30020 hCov-OC43-RdRP 假病毒标准品
点击次数:18发布时间:2022/2/9 10:29:41
更新日期:2022/2/9 10:29:41
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产品型号:CBV30020
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详细内容
HCoV-229E和HCoV-OC43都是在1960年代发现的,多年来一直被公认为引起普通感冒的原因,并在一生中引起频繁的再感染。在成年人中,这些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4%至15%,在高峰期高达35%。儿童的年发病率达到8%,发病率高达20%。据报道,成人中229E和OC43病毒的感染频率为每年每100人15至25人不等,其中有80%的感染者是先前具有该感染病毒抗体的人。
NCBI收录序列为KX344031.1,全长30713bp,基因编码5个结构蛋白:S,M,N,HE和E。
S蛋白(spike protein)穿过病毒膜,并在冠状病毒“冠状”中形成特征性的尖峰。它被高度糖基化,可能形成同源三聚体,并介导受体结合和与宿主细胞膜融合。刺激中和抗体的主要抗原以及细胞毒性淋巴细胞的重要靶标在S蛋白上。
M蛋白(membrane glycoprotein)具有一个短的N末端结构域,该结构域在包膜的外表面上突出并跨过该包膜3次,在包膜内留有一个长的C末端。M蛋白在病毒装配中起重要作用。
核衣壳蛋白N(nucleocapsid phosphoprotein)与RNA基因组结合形成核衣壳。它可能参与病毒RNA合成的调控,并可能在病毒出芽过程中与M蛋白相互作用。
HCoV-OC43中发现血凝素酯酶糖蛋白(HE)。血凝素部分与宿主细胞表面的神经氨酸结合,可能使病毒*初吸附到膜上。酯酶从神经氨酸裂解乙酰基。冠状病毒的HE基因与C型流感HE糖蛋白具有序列同源性,可能反映了这两种病毒之间的早期重组。
小包膜E(envelope protein)蛋白将其C末端留在包膜内,然后跨越该包膜或弯曲并在内部投射其N末端。
根据CDC和WHO的介绍,针对HCoV-OC43的核酸诊断一般是针对RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于对应药物和疫苗的开发。
以往针对试剂盒检测限的性能评价,一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品,用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定,首先体外转录的RNA,一般是很纯,单一,不涉及提取,不符合临床病毒的微环境,因此必然造成检测灵敏度被高估,这也是存在高概率假阴性的主要原因;再次临床阳性病毒,即使是灭活的病毒,也是存在很大的生物安全隐患,因此要求实验室级别为P3-P4,大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求,另外临床阳性病毒也是来源很有限,不能被稳定供应,反复用于试剂盒的性能评价。
因此,有病毒的完整包膜结构,有HCoV-OC43对应的核酸序列,但是生物安全风险较低的假病毒标准品,的克服了如上的缺点,非常适合用于核酸诊断性能评价的标准品。
科佰生物开发了基于NCBI公布序列的假病毒产品,用于各诊断试剂盒的性能评价,其对应的优点如下:
hCov-OC43-RdRP 假病毒标准品,区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒,克服两者的缺点,真正适合用于试剂盒的性能评价,包含检测限、特异性,重复性等;
根据HCoV-OC43冠状病毒的特点,选取了RdRp(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合计3个区段的序列,用于假病毒的包装,3个区段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列;
科佰生物设计了ddPCR体系的引物、探针序列,可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测,非常表征标准品的拷贝数,而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不性;
hCov-OC43-RdRP 假病毒标准品,无致病性,可再生,质控方法,批次间稳定,可以稳定制备和供应,而且要求实验室生物安全级别为P2,满足很多单位的安全需求。