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实验介绍：
Label free是一种不依赖于同位素标记的非标记蛋白组定量技术，通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内标，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
实验流程：
蛋白提取与酶解→Label free→质谱分析→蛋白定性定量→组学生物信息学分析
应用方向：生物域各个研究方面，如：
1. 农林域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等
2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等
3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等
4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等
5. 微生物域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等
6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等
7. 生物能源、环境科学域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等
8. 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等
数据分析
标准数据分析内容 | |
蛋白质总鉴定数量分析 | 蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图 |
差异蛋白质功能分析 | 亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析 |
质量控制分析 | 肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
高数据分析内容 | |
WGCNA共表达分析 | 获得与表型强关联的核心蛋白质 |
趋势聚类分析 | 探讨蛋白质的表达趋势模式 |
技术优势
? 无需昂贵的同位素标记试剂，实验周期短
? 可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较
? 克服标记定量技术在样本数量的上限制，灵活方便
