不管是在实验室中还是在工业生产的一些需要对细胞进行实验中都是需要在实验前就要对其进行破碎。其中破碎的常见方法有以下几种。

超声波细胞破碎法

超声波细胞破碎法是由电能转化成声能，通过物理反应让细胞壁细胞膜破碎并且使原始属性不会被破坏，超声波细胞破碎法的破碎效率高并且均匀，是现在很多实验室和工业化生产常用的方法。

化学破碎法

采用化学法处理可以溶解细胞或抽提胞内组分。

捣碎破碎法

一般用组织捣碎机，适用于动物组织及植物组织的破碎。

研磨破碎法

一般手工研磨，适用少量的细菌或坚硬之物组织。

匀浆破碎法

主要是利用高压827bar使细胞破碎。

温差法破碎法

主要通过反复的冻溶或急热骤冷等温度变化来达到目的

自溶破碎法

主要通过一定的pH和温度，借助细胞内的自身酶系使细胞破碎。

渗透压冲击破碎法

渗透压冲击是属于较为温和的一种破碎方法，将细胞放在高渗透压的溶液中，由于渗透压的作用，细胞内水分便向外渗出，细胞发生收缩，当达到平衡后，将介质快速稀释，或将细胞转入水或缓冲液中，由于渗透压的突然变化，胞外的水迅速渗入胞内，引起细胞快速膨胀而破裂。多数用于生物课程的实验中。

冻融破碎法

将细胞放在低温下冷冻（约-15℃），然后在室温中融化，反覆多次而达到破壁作用。由于冷冻，一方面能使细胞膜的疏水键结构破裂，从而增加细胞的亲水性能，另一方面胞内水结晶，形成冰晶粒，引起细胞膨胀而破裂。

酶溶破碎法

酶解是利用溶解细胞壁的酶处理菌体细胞，使细胞壁受到部分或完全破坏后，再利用渗透压冲击等方法破坏细胞膜，进一步增大胞内产物的通透性。真核细胞的细胞壁不同于原核细胞，需采用不同的酶。