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公司新闻
北京师范大学Nature点评酶研究新成果
点击次数:854发布时间:2013/5/17
甘油二酯激酶(diacylglycerol kinase,DgkA)如何能通过这么少的氨基酸残基形成细胞膜锚定以及活性位点,一直以来都是一个迷,近期的一项研究揭示了其晶体结构,从中研究人员发现了这个奥秘。
生物通报道:这种称为甘油二酯激酶的细菌酶是一个“反叛小子”,现在研究人员通过解析大肠杆菌中甘油二酯激酶的晶体结构,揭示了这种酶如何利用其残基附近的环境,完成功能使命的,这极大的促进了我们对于这种蛋白的了解,也有助于从整体上分析完整的膜酶。
来自北京师范大学,加拿大皇后大学的贾宗超教授和郑积敏博士以“Structural biology: Tiny enzyme uses context to succeed”为题,介绍了这项研究成果,并指出激酶是目前研究的*多,和*广泛的的蛋白质家族,但DgkA的相关研究还是带给了我们不少惊喜,这种酶独特的结构和复合活性位点都为激酶研究带来了新的思考。北京师范大学长江学者贾宗超教授,与郑积敏博士一直致力于结构生物学方面的研究,曾破解了一种双功能蛋白:异柠檬酸脱氢酶(ICDH)磷酸激酶/磷酸酶(AceK)及其与底物复合物的晶体结构,从而解析了大肠杆菌和沙门氏菌这类的细菌如何能在低营养环境,比如水环境中生存的调控机制。(专访皇后大学及北京师范大学贾宗超教授:双功能酶新发现)
在*新这篇文章中,他们介绍道,甘油二酯激酶DgkA在进化上独具一格,其完整的膜蛋白从功能和结构上都有别于其他已发现的激酶。DgkA的大小仅为121个氨基酸残基,因此要了解这么小的一个酶如何能跨越细胞膜,并形成功能活性位点,用以承载一个庞大的脂肪底物,和一个水溶性ATP分子,这令科学家们颇为头痛。研究人员解析了大肠杆菌中甘油二酯激酶的晶体结构,从中发现了这种酶如何利用其残基附近环境的奥秘——酶中每个单体都“借用”了“邻居”的组成成分,构成组成性活性位点。这种借来的元件同时具有亲水性和疏水性的氨基酸末端螺旋,能定位在膜和胞质之间界面上,组成了一个关键的催化残基。
而且有趣的是,这种晶体结构与以前通过核磁共振(NMR)获得的DgkA“只有骨架”的结构并不相同,虽然DgkA整体同源三聚体结构是一致的,但是活性位点却存在巨大的差别。这种不同的结构可能反映了两个分析的不同条件,但是由于DgkA同源三聚体的极端热稳定性(可在温度高达100°C下生存),因此要了解其中的转换过程并不容易。DgkA酶巧妙设计了它的活性位点,这比其它种类的酶都要简单,事实上,DgkA结构解析将会为膜蛋白的相关催化机制和构架提出新的研究方向,未来科学家们可以进一步解析这种酶的催化机制,以及调控机理,并深入探讨NMR方法和晶体结构方法之间的分辨率差异。 来源:生物通