近阶段，一般食品企业根据国家法律和相关标准要求，微生物指标为产品出厂必检项目。而2014年国家标准检查方法由于检测周期长，对检验人员能力要求高等原因，在食品企业内没有很好地开展，而在巴氏杀菌乳和发酵乳等保质期短的产品出厂检验中，不进行致病菌检测已经是行业潜规则。
   
       有关方面的专家分析，现行食品安全微生物学检验国家标准基本以培养分离法为主，而这些检测方法由于人为干扰、交叉污染及其方法本身的局限性，会对检测造成较大风险：可靠性较低、重现性较差、周期长、依赖专业人员的判断能力和从业经验等主观因素，耗费人力物力，导致检测风险变大而效率变低，妨碍了标准化质控管理，降低了用户出具报告时的自信心。

       对乳品企业而言，自身的环境监测和生产过程控制比样品检测更为重要。确保厂区内洁净作业区的设施和环境不会对产品带来微生物污染，才能真正保证产品安全。而传统的方法很难满足微生物风险评估、监测和污染溯源的需求。

      面对日益严峻的微生物风险的挑战，面对如此之多棘手的检测难题，面多越来越严格的法规要求，乳品企业急需基于DNA分析技术的高效检测设备以满足未来的应用需求。所以有关这方面的检测设备更待发展突破。