农用杀菌抗生素对病原菌的作用机制可概括为4种情况：①干扰菌丝体细胞壁的合成；②损伤筒体细胞膜的通透性；③影响菌体蛋白质的合成；④抑制核酸的合成。一般都在很低的浓度下对病原菌产生作用，这是杀菌抗生素有别于其他化学杀菌剂的重要特点。我国已大规模生产的农用抗生素有井冈霉素，主要用于水稻纹牯病（病原为担子菌亚门薄膜革菌属PellicuLariaa sasakii）的防治。

    用农用杀菌抗生素防治病害时，可通过用抗生素浸种或苗床喷洒等方式防治种子、秧苗传染的病害；选择适当时期进行植株、叶部喷洒，防治作物地上部分病害；对树干的病部可将抗生素制成油膏进行涂敷或涂刷。

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