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发育中的DNA“交流”
点击次数:280 发布时间:2013/3/10 22:53:39
在胚胎发育过程中,基因的启动和关闭受到精确调控。基因动态给不同细胞赋予了不同的特性,让胚胎发育成为比例恰当的健康动物。Fgf8是这一过程中的关键基因,它编码一个关键信号因子,控制着四肢生长和大脑不同区域的形成。
日前,欧洲分子生物学实验室EMBL的研究人员,确定了在哺乳动物胚胎发育过程中控制Fgf8表达的调控模块,阐明了这一系列调控元件(增强子)控制Fgf8的机制。文章于二月二十八日发表在Cell旗下的Developmental Cell杂志上。这项研究强调了,基因组结构对于基因调控的重要性。
研究人员发现,在一个基因组大区域聚集着一系列Fgf8增强子,虽然其间也穿插着一些不相关的基因,但这些调控元件只对Fgf8起作用。这些元件的序列和排列在进化中非常稳定,这说明了它们的重要性。研究显示,选择性改变这些调控元件的相对定位,会改变它们对Fgf8的作用,从而极大地影响胚胎发育。
“我们发现,这一基因组区域中的复杂组织形式,是Fgf8调控的关键方面,”领导这项研究的François Spitz说。“特定调控元件对Fgf8的影响,取决于该元件的特殊位置,而非这个元件的序列。这说明该区域中,启动子对基因的影响并不依赖特定的识别标签,而是与定位有关。”文章提出,该基因组区域的结构,控制着区域中调控元件的内在活性。
科学家们仍在深入研究这一调控的详细分子机制。他们认为,很可能在特定条件下,DNA的3D折叠能使调控元件彼此组合,并与Fgf8接触以激活或阻止基因表达。该研究所强调的基因调控层次往往容易受到忽视,这些调控元件并不与拥有相应序列的特定基因一一对应。在这里,基因组的局部组织形式和DNA的3D折叠实际上更为重要,它们不仅控制着调控元件的活性,也介导了调控元件与目标基因的接触。
DNA的3D结构如何调节基因组元件的相互交流,又对基因表达调控有何具体影响,这些还有待进一步研究。这些将帮助我们深入理解,基因组重排怎样影响上述3D调控网络,并由此引发相应疾病和畸形。
原创作者:上海继锦化学科技有限公司