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免疫学实验常见Q&A集锦二

点击次数:259 发布时间:2016/9/8
免疫学实验常见Q&A集锦二
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WesternBlot常见问题及处理:
16、细胞水平要做westernblot,多少细胞提的蛋白够做westernblot?答:一般5×10^6就足够了
17、同一样品能同时提RNA又提蛋白么?这样对westernblot有无影响?答:能,没有问题。
18、同一蛋白样品能同时进行两种因子的WesternBlot检测吗?答:当然可以,有的甚至可以同时测几十种样品。
19、如果目标蛋白是膜蛋白或是胞浆蛋白,操作需要注意什么?答:如果是膜蛋白和胞浆蛋白,所用的去垢剂要温和得多,这时加上NaF去抑制磷酸化酶的活性。
20、我的样品的蛋白含量很低,每微升不到1微克,但是在转膜时经常会发现只有一部分蛋白转到了膜上,就是在转膜后染胶发现有的孔所有的蛋白条带都在,只是颜色变淡了,有什么办法可以解决?答:你可以加大上样量,没有问题,还有转移时你可以用减少电流延长时间,加20%甲醇。
21、想分离的蛋白是分子量200kd的,SDS-PAGE电泳的分离胶浓度多大合适?积层胶的浓度又该用多少?这么大分子量的蛋白容易作WesternBlot吗?答:200kd的蛋白不好做,分离胶用7%,积层胶3.5%。
22、如果上样量超载,要用什么方法来增加上样量?答:可以浓缩样品,也可以根据你的目标分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超载30%是不会有问题的。如果已经超了不少了,而且小分子量的也要,可以考虑加大胶的厚度,可以试试1.5mm的。
23、蛋白变性后可以存放多久?答:-80℃,一两年没有问题。*关键两条:不要被蛋白酶水解掉;不要被细菌消化掉(也是被酶水解了)。
24、我所测定的蛋白分子量是105KD,按理说分离胶应当采用7.5%,但资料却要求分离胶和浓缩胶均采用11%的配方,不知为何?答:上述提到的两种凝胶均可以使用,因为105KD的蛋白在上述两种胶的线性分辨范围内,但需注意条带位置。
25、二抗是生物素化的抗体,三抗是亲和素生物素体系,不知采用这样的方案后,封闭液是否要作调整,能否再用5%的脱脂奶粉呢?好像有资料说脱脂奶粉会影响亲和素生物素的生成,是吗?解答:不能使用脱脂奶粉,因为脱脂奶粉中含生物素,用BSA代替应该好一点.
26、问一般一次上样的蛋白总量是多少,跟目的蛋白的表达量有关系吗?答:WesternBlot一般上样30-100微克不等,结果跟目的蛋白的丰度、上样量、一二抗的量和孵育时间都有关系,也与显色时间长短有关。开始摸条件时,为了拿到阳性结果,各个步骤都可以量多一点时间长一点,当然背景也就出来了。要拿到好的结果,如果抗体好的话比较容易,抗体不好的话就需要反复地试了,当然有的不适合WesternBlot的怎样做也不行。
27、做组织样品的western的时候,怎样处理样品?答:必须进行研磨、匀浆、超声处理,蛋白质溶解度会更好,离心要充分,膜蛋白需用更剧烈的方法抽提,低丰度膜蛋白可能还要分步抽提(超速离心)。还有一点就是组织中的蛋白酶活性更强,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
28、问大分子量蛋白200KD,在做western要注意什么呢?答:做200kd蛋白的WesternBlot时要注意,分离胶选择>7%的;剥胶时要小心;转移时间需要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析)。
29、有什么方法可以提高上样量?答:a)可以浓缩样品;增大上样体积来增大上样量;b)用5倍的上样缓冲液来稀释变性
30、蛋白的上样量有没有什么具体的要求?答:上样量要根据实验的要求来定,如果要求是定量和半定量的WesternBlot则上样量要均等,如果只是要定性,则没有太大的关系,尽量多上就行了,但是不要超载.
31、一抗,二抗的比例是否重要?答:比较重要,调整好一抗,二抗的比例,可以去掉部分非特异的本底。
32、要做磷酸化某因子WesternBlot,其二抗有何要求?答:对二抗无要求,要看你实验条件来选择,一般推荐用HRP标记的二抗。
33、免疫组化和WesternBlot可以用同一种抗体吗?答:免疫组化时抗体识别的是未经变性处理的抗原决定簇(又称表位),有些表位是线性的,而有的属于构象型;线性表位不受蛋白变性的影响,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;构象型表位由于受蛋白空间结构限制,煮后变性会消失。如果你所用的抗体识别的是蛋白上连续的几个氨基酸,也就是线性表位,那么这种抗体可同时用于免疫组化和Western,而如果抗体识别构象形表位,则只能用于免疫组化。
34、WesternBlot中抗体的可以重复应用吗?答:抗体工作溶液一般不主张储存反复使用,但是如抗体比较珍贵,可反复使用2-3次。稀释后应在2-3天内使用,4度保存,避免反复冻融。

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