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CNV分析

点击次数:282发布时间:2012/3/30 10:20:03

CNV分析

更新日期:2012/3/30 10:20:03

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简单介绍:上海拜沃以质量为本,树立“拜沃质量”是公司的发展目标。我们一直加倍努力,竭尽做到不辜负您的支持与信赖。同时公司也离不开广大客户的帮助支持,真诚邀请国内外有实力的实验室、生物技术公司合作,共同发展。目前拜沃提供的服务范围包括:生物合成siRNA、shRNA的制备;转录编码shRNA的DNAs、转录编码shRNA的质粒载体订购;siRNA靶位的设计和实验选择分析;siRNA相关试剂和RNA技术相关产品的代理销售;重组病毒构建包装;基因蛋白表达、载体构建、多克隆抗体和单克隆抗体制备;多种细胞学服务;常用的分子生物学试剂、实验仪器、实验耗材销售等。 拜沃在分子生物学和免疫学实验技术,特别抗体制备技术方面同样具有丰富经验,提供快速、、性价比高的实验服务。

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详细内容

 

CNV分析
1.适合10-200个基因的定量分析,无需昂贵及费时的荧光标记
2.CNV与儿童成神经细胞瘤、唐氏综合症、精神分裂症、结肠癌、艾滋病、奥茨海默症等疾病相关

技术优势:

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灵活:自动化实验设计软件,常规可达20重定量分析;

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精确:在很宽的线性范围内提供极高的定量精确度(3%cv,可检测出低至10%的表达差异;

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灵敏:检测1aM(每个反应3个拷贝),微量的实验样本(低至5pgDNA;

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经济:384微孔板中达到高水平的多重定量分析,适合10-200个基因的定量分析,无需昂贵及费时的荧光标记。

   
基因拷贝数变异(copy number variationCNV)是指在基因组中广泛存在的,从1000bp到数百万bp范围内的大片段碱基缺失、插入、复制和复杂的重组,是一种核酸片段拷贝数量的变异。在一些SNP检测中,会看到杂合子的分群分布,很可能是该SNP位点所在序列在基因组中有多个拷贝造成的。

SAR(SNP allele ratio)
   
检测待测拷贝片段存在的SNP,计算峰面积,得出该位点两种基因型的相对比值。从而推测含不同SNP基因型拷贝的相对比值。
  
ACN(absolute copy number)
   
人工合成一个与待测拷贝序列只有一个碱基差异的竞争子片段,即可以实现待测拷贝序列在基因组中的绝对定量检测。
  
ASCN(allele specific copy number)

    待测拷贝序列存在SNP位点,再引入人工合成的竞争子片段,即可同时实现相对和绝对的拷贝数定量分析。
结果示例:


CNV与疾病

儿童成神经细胞瘤:
   
染色体1q21.1上的一个常见CNV与儿童癌症成神经细胞瘤有关,而且这一CNV内的一个转录体(NBPF23)也参与了肿瘤形成的早期阶段 Sharon J. Diskin1,2, etc. Copy number variation at 1q21.1 associated with neuroblastoma, Nature, 2009, June(18), 459, 987-991.

唐氏综合症:
    CNV
是唐氏综合症的病因,患者多了一份21号染色体。

精神分裂症:
   
由美国精神分裂症协会主持开展,对3400名分裂症患者及3200名健康人开展了调查,结果显示相对于健康对照,某些特定基因的拷贝数突变将导致发病几率提高1.15倍。

结肠癌:
   
英国爱丁堡大学的研究者报告称,他们从2200例结肠癌患者中筛查得到了一个CNV,这是一个具有控制免疫系统功能的基因,在患者组出现的几率是健康对照的3倍还多。

艾滋病:
    CCLL3L1
基因的拷贝数变异会影响到艾滋病的易感性。

奥茨海默症:
APP基因则与奥茨海默症相关。

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