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血红素换个“心”,催化大不同-齐一生物
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John F. Hartwig教授是著名有机化学家,2012年当选美国科学院院士,现年52岁,重点是很帅。
图片来源:University of California, Berkeley
血红蛋白的一大特征是拥有Fe-卟啉IX(Fe-PIX)辅因子,原始的血红蛋白可以催化C-H键氧化和卤化反应,并且可以成功地应用于非生物底物。而以Fe-PIX为核心的其他酶,可以催化卡宾、氮宾与烯烃或X-H键的插入反应(X = N, S)和端芳香烯烃的环丙烷化,但对不活泼的C-H键和烯烃的类似反应则无效。
在以往的研究中,科学家已经发现对于一些反应,小分子Ru/Rh/Ir-卟啉的催化效果远好于Fe-卟啉分子,于是他们在想,用这些贵金属代替这些酶中的铁能否收到奇效?
这个想法并非首创,实际上Mn/Cr/Co核心的“血红蛋白”已经被报道过,只是它们的催化活性都不如Fe-PIX,对Ru/Rh/Ir核心的催化效果,John F. hartwig团队的成员心里也没底。(Abiological catalysis by artificial haem proteins containing noble metals in place of iron. Nature, 2016, DOI: 10.1038/nature17968)本文由专注于提供生物科技服务的齐一生物收集整理
计划的步是要合成出相应金属核心的酶。已有的方法包括组合法和单一表达法。组合法需要先用酸把血红蛋白的结构打破,释放出Fe-PIX后,再使空的血红蛋白(apo-PIX)折叠回原样。之后再与不同的M-PIX(M为各种金属)混合,得到产物后分离纯化。这一过程非常繁琐,产率低下。另一种单一表达法比较简单,直接表达出M-PIX核心的蛋白,但几乎每一种金属都要换一个表达方法,缺乏普适性,效率依旧不高。于是本文的研究人员开发了一种新的表达系统。
他们尽量降低大肠杆菌培养基中铁盐的含量,以抑制血红素的合成,并保持较低的温度使apo-PIX蛋白保持稳定。*终他们得到了含铁量低于5%的apo-PIX蛋白。这些蛋白与不同的M-PIX混合,填补蛋白中的空位,便能得到不同的M-PIX蛋白。
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M-PIX蛋白制备过程。圆二色光谱表明细菌中表达的apo-PIX蛋白、加铁后的蛋白与天然的Fe-PIX蛋白在构象上没有差别。图片来源:NPG
获得了这些M-PIX蛋白后,研究人员比较了不同金属核心的酶催化卡宾的C-H键插入反应及芳香烯烃加成反应的活性。结果表明Ir(Me)-PIX蛋白的催化活性。
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基于此,为了获得高的对映选择性和产率,研究人员又对PIX结合位点附近的重要氨基酸逐一做了突变、筛选(93G代表蛋白质93号氨基酸为甘氨酸G)。
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Ir(Me)-PIX蛋白的不同突变体不仅弥补了Fe-PIX蛋白的不足,能够成功催化卡宾的C-H键插入反应和不活泼烯烃加成反应,而且对映选择性、催化剂转换数TON(单位时间内转化的底物的物质的量/催化剂的物质的量)都相当不错。本文由专注于提供生物科技服务的齐一生物收集整理