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发布时间:2018/4/25 来源: 齐一生物科技(上海)有限公司 阅读次数:610
Ralf Jauch 课题组长期致力于研究转录因子蛋白与基因组结合调控的分子机制。课题组在前期研究中,利用新的生物信息学算法分析得到了包括 FOXA1 同源二聚体结合位点的一批新的转录因子二聚结合基序位点,紧接着围绕着 FOXA1 的同源二聚体基序开展进一步的研究。该研究首先利用生物化学技术体外验证了 FOXA1 蛋白能够以二聚体形式结合在新基序上,蛋白结构模拟显示 FOXA1 蛋白分子的二聚结合是由 DNA 基序介导的,基因组测序结果显示 FOXA1 在乳腺癌和肝癌细胞中 FOXA1 蛋白在二聚体基序上富集并能够在 PI3K 信号通路被抑制的时候调控染色质动态变化,其次,进一步通过生物信息学以及细胞生物学技术筛选出了能够影响 FOXA1 二聚结合的与疾病相关的单核苷酸多态性(SNP),其中有着与骨质疏松及帕金森疾病相关的致病 SNP,为未来相关疾病的研究治疗提供了新的方向。
论文的第一作者为博士生王学聪,通讯作者为研究员 Ralf Jauch,该工作得到了新加坡基因研究所、波兰华沙大学、麻省理工 - 哈佛大学博德研究所、德国马普研究所等合作者的大力支持。
左图显示 FOXA1 同源二聚体结合基序(DIV),右图迁移试验证明 FOXA1 能够与 DIV 基序二聚化结合(D 部分)
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