细胞凋亡是一种在基因控制下的细胞主动死亡过程,通常表现为核浓缩,起皱,膜发泡以及 DNA 片段化。WB 是研究细胞凋亡机理的基本方法之一,但是 WB 也不是谁都能做成功的,因为有可能你的第一步就做错了!用 WB 做细胞凋亡研究样品制备是第一步,样品制备方法至关重要否则会得到错误的结果和结论。
样品制备,看你是不是这样做的:
自配裂解液或者购买 RIPA,加上样品研磨啊研磨,孵育啊孵育,然后离心扔掉沉淀(RIPA 不可溶组分),取上清(RIPA 可溶组分)进行下游实验。
对对对!都是这么做啊,扔了取上清!
且慢,我们扔掉了,扔掉了,扔掉了一些啥?要不要紧,影响细胞凋亡的实验结果不?
例一. Zapata et al., (1998). Granzyme Release and Caspase Activation in Activated Human T-Lymphocytes. J Biol Chem 1998, 273:6916-6920.
Caspase 家族在介导细胞凋亡的过程中起着非常重要的作用,其中 caspase-3 为关键的执行分子,它在凋亡信号传导的许多途径中发挥功能。Caspase-3 正常以酶原(32KD)的形式存在于胞浆中,在凋亡的早期阶段,它被激活,活化的 Caspase-3 由两个大亚基(17KD)和两个小亚基(12KD)组成,裂解相应的胞浆胞核底物,最终导致细胞凋亡。但在细胞凋亡的晚期和死亡细胞,caspase 的活性明显下降。
研究方法:
1.分别使用 RIPA 和 2%SDS + 超声提取未激活 T 淋巴细胞(Lanes 1 和 5)和激活的 T 淋巴细胞(Lanes 2-4 和 6-8)裂解细胞提取总蛋白
2.WB 进行 caspase-3, caspase-7, parp and GD1 检测
主要发现:
p24, p20 存在于 RIPA 提取的蛋白中,但 Laemmli 裂解液提取的蛋白中却不存在。证明了 RIPA buffer 提取蛋白时会人工激活 caspase-3 and caspase-7。用 Laemmli 缓冲液加超声处理可进一步从 RIPA 不可溶性组分中提取出蛋白。