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染料法支原体污染实时定量PCR试剂盒
Dye-quantitative Real-time PCR Kit for Mycoplasma contamination
货号:Myco-qs-20,规格:20个反应
货号:Myco-qs-50,规格:50个反应
货号:Myco-qs-100,规格:100个反应
储存:-20度,避光保存,有效期年。避免反复冻融。
试剂盒特点:
1,本试剂盒对柔膜菌纲(包括支原体、螺原体和无胆甾原体)有强的特异性,与柔膜菌纲以外的其他基因组无交叉反应。
2,本试剂盒灵敏度高,低可检出反应液中2-4个基因组。
3,本试剂盒使用热启动的Taq酶,可抑制非特异性扩增,降低背景荧光。
4,本试剂盒带有阳性对照样品(组分C),可用于检验试剂盒有效性,也可用于验证待测样品中是否含有PCR抑制剂。
5,本试剂盒带有ROX参比染料,帮助校正加样误差和管间差异。
支原体(Mycoplasma)属于柔膜菌(Mollicutes)纲,直径约0.1-0.3 µm,具有变形能力,因此可以轻易穿过常规的0.22 µm无菌滤膜,是常见的动物细胞培养污染源。由于支原体体积太小,在光学显微镜下不可分辨,因此细胞常常在不知不觉中被污染。
目的经典检测方法是欧洲药典(European Pharmacopeia)2.6.7规定的体外培养法,用特殊培养基对支原体进行培养,以此检测污染情况。培养法的优点是检测灵敏度高,缺点是耗时较长,长的需要28天之久,而且受操作人员的技能水平影响较大,不同实验室的检测误差较大。随着生物制药业的发展,很多生物制品保质期较短,因此需要种快速、灵敏并且特异性强的支原体检测方法。欧洲药典因此接纳了核酸检测方法作为培养法的替代方案。定量PCR法可以在几个小时内完成检测,灵敏度与培养法相当,甚至更好。
本试剂盒以16S rRNA基因为靶点,设计了多对引物,可检出大部分已知的支原体,以及部分螺原体和无胆甾原体,与亲缘关系较近的革兰氏阳性菌,如链球菌、梭菌、乳杆菌等,没有交叉反应,在检测范围和特异性方面达到欧洲药典的要求。欧洲药典提及的所有支原体均在本试剂盒的检测范围内。灵敏度方面,低检测值可以达到每个反应2-4个基因组,在不考虑DNA提取损耗的情况下,达到欧洲药典要求的10 CFU/mL的低检测值。
本试剂盒包含热启动Taq酶、dNTP(以UTP代替了TTP)、引物、阳性对照品、SYBR Green I染料、ROX染料,和用以防止残余DNA污染的UDG(尿嘧啶-N-糖苷酶),用户只需准备好DNA样品即可使用。
注意事项:
1,本产品仅限于科研使用,不作诊断用途。
2,操作过程中应注意防范样品之间的串联污染。好对工作区域进行划分,将不同步骤,如DNA提取和PCR反应液的配制,分开在不同阶段不同区域进行。使用无污染的次性枪头,好是带滤芯的枪头。好在通风区域操作,操作时须佩戴无粉尘手套。
3,对于在584 nm附近可产生激发光的仪器(大部分使用钨灯或卤素灯作为光源的仪器,还有些仪器门配置了LED灯,可激发~584 nm光源),ROX的反应浓度为30-50 nM。对于不能在584 nm附近可产生激发光的仪器(大部分以激光为光源的仪器),ROX的反应浓度为300-500 nM。具体可参考仪器的使用手册。
热启动Taq酶结合了特异性单克隆抗体的DNA聚合酶,在室温下聚合酶活性被抗体抑制。在PCR循环的变性阶段,抗体受热被去除,聚合酶活性恢复,因此获得“热启动”功能,可减少残余DNA的污染,提高PCR扩增效率、灵敏度和目的片段产量。
SYBR Green I可以与DNA双链的小沟结合,结合后在497nm激发光照射下产生520nm的发射光。未结合双链DNA的SYBR Green I基本不产生荧光。因此可以根据荧光值的大小判断溶液内DNA双链的多寡,用于实时检测PCR反应过程中产物的累积量。初始模板浓度越高,反应循环数越高,则双链DNA含量越高,荧光值也就越高。值得注意的是,SYBR Green I也可以结合非特异性PCR产物以及引物二聚体,此时产生的荧光与目标扩增产物无法区分。为了判断荧光信号是否来自目标扩增产物,可以绘制熔解曲线。通过逐步缓慢升温,使双链DNA解离为单链DNA,同时检测荧光值的变化,绘制曲线,根据荧光值观察DNA解链的温度。
UDG和dUTP可以阻止次步骤残余DNA的扩增。dUTP可以确保扩增后的DNA中均含有尿嘧啶。UDG可从单链或双链DNA上去除尿嘧啶残基,从而阻止含有尿嘧啶的DNA作为下几轮PCR的模板。在PCR循环开始的UDG孵育步骤,可以破坏带有尿嘧啶的PCR产物。经过该去除污染步骤后,UDG在正常的PCR循环过程中被高温灭活,对PCR反应没有影响。
ROX不参与PCR反应,在PCR反应过程中荧光没有变化,可以提供条基线用于校正加样误差和管间差异,便于仪器自动分析报告荧光与内参ROX荧光的比值,使定量更准确。ROX染料的激发波长为584nm,发射波长为612nm。用ROX进行校正后可以使实验误差减小十倍左右。
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