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篇文献-CUT&RUN优点全现

篇文献-CUT&RUN优点全现

  • 价 格: 电议
  • 型号:
  • 生 产 地:中国大陆
  • 访问:0次
  • 发布日期:2021/10/15(更新日期:2021/10/15)

武汉艾美捷科技有限公司

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EpiNext CUT&RUN Fast Kit,从低输入提供无超声破碎,以可靠地识别真正的目标蛋白质富集区域并实现高分辨率定位。可满足快速富集蛋白质结合的DNA并绘制全基因组蛋白质/DNA相互作用的图谱的需求。
  • 详细内容
  • 公司简介
 作为ChIP的高效替代方案你可能不知道CUT&RUN有多业,那小编就拿下面这篇文献来分析下吧~

 

文献:Targeted in situ genome-wide profiling with high efficiency for low cell numbers

 

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随着技术的发展,ChIP-seq的改进可以实现TFs 6-8碱基对分辨率的映射,但实验结果还是存在很多问题,比如说ChIP的高背景限制了灵敏度,需要的细胞比较多以及交联和增溶产生的假象。而CUT&RUN相比于传统ChIP在细胞量和信噪比等方面的优势。

 

1)在整个实验过程中,pMNase的量对片段化的结果至关重要

 

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fig1.两批样品500μl体积中,600,000K562细胞,加入不同浓度的pA-MN,片段化之后,采用TapeStation 通过分析荧光强度来分析pA-MNH3K27me3基因组片段化的影响。

 

2)CUT&RUN技术用于少量细胞,信噪比很好

 

研究者检测了100-6000个K562细胞的H3K27me3的基因组分布,发现在低至100细胞时,CUT&RUN仍可以很好地检测出H3K27me3的峰,而且在异染色质区也样可以看到峰。

 

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fig2.CUT&RUN可以检测低至100细胞的H3K27me3基因组分布(aENCODE数据库中的K562细胞的H3K27me3 ChIP-seq结果,及6000-100K562细胞的H3K27me3 CUT&RUN结果。(bCUT&RUN结果的散点图,以50bp为个bin,相对于阴性对照IgG6000细胞与100细胞有明显更强的相关性。(c)热图显示6000-100细胞的CUT&RUN结果有很好的相关性。

 

3)CUR&RUN技术检测的信噪比要比传统ChIP-seq高很多

 

研究者检测了转录因子CTCF的基因组结合位点,发现CUR&RUN技术检测比ENCODECTCF ChIP-seq的信噪比要高很多,而且只需1.25万细胞就能得到很高质量的结果。尽管用1000细胞则会损失些峰。

54.jpg

fig3.用CUT&RUN检测CTCF的结合位点,比ENCODE中的CTCF ChIP-seq信噪比高很多。

 

本文图2、图3分析源自CST公司。

艾美捷作为表观遗传域业的解决方案供应商,推荐EpiGentek的EpiNext CUT&RUN Fast Kit,cat#:P-2028,该试剂盒从低输入提供无超声破碎,以可靠地识别真正的目标蛋白质富集区域并实现高分辨率定位。可满足您快速富集蛋白质结合的DNA并绘制全基因组蛋白质/DNA相互作用的图谱的需求。

 

来源:https://www.amyjet.com/featured/cutrun-2.shtml


武汉艾美捷科技有限公司(AmyJet Scientific Inc),简称艾美捷科技(AmyJet Scientific)。2010年底成立于九省通衢的湖北省武汉市,历经五年多的发展,已成为国内知名的集进口试剂、实验室耗材销售、技术服务与合约开发为一体的专业化高科技生物企业。艾美捷科技总部设在武汉市洪山区光谷大道35号光谷总部国际二期时代1号楼13层,业务覆盖全国。
 
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艾美捷科技与国内外优秀的生物试剂供应商保持着密切的合作关系,目前已成为众多国际知名品牌的中国总代理或一级代理,主要包括:Merck Millipore、Origene、AAT Bioquest、ABGENT、 Cayman Chemical、Abnova 、Biovision、ProSpec、Hycult Biotech 、Equitech-Bio、Trevigen、Alomone Labs、Epigentek、Abbkine、ImmunoReagents 、Jackson、SouthernBiotech、US Biological 、VIVA Bioscience 、Caisson Labs等,可以在第一时间为用户提供最前沿的专业资讯、完备的产品及物流服务。
 
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                                                                           办公区  
随着公司业务的壮大,为了更好的服务客户,公司组建了一支在生物领域经验丰富的研发团队-艾美捷生物技术中心,宣布进入自主研发阶段,以期将更多更优质的产品推荐给国内生物领域的同仁。相信在不久的将来,将陆续有印有艾美捷Logo的产品与大家见面,并逐渐受到大家的认可!
 
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                                                                    实验室&培训区
专业的技术力量使我们能够为广大用户提供强大的技术支持,深厚的人脉资源使我们在全国主要城市拥有众多合作伙伴,艾美捷科技非常荣幸能将世界上最先进的生物产品推荐给国内从事生物学领域科研的老师和同仁,配备的优秀销售队伍以及专业的技术支持,随时为客户提供技术咨询和售后服务。
作为专业性的产品供应公司,公司出资储备了大量现货;作为产品研发公司,公司必将不遗余力,努力向专业化、国际化标准迈进,打造科技与服务并存型企业!
诚挚邀请各位供应商、经销商、老师们莅临艾美捷科技参观、指导!
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