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CUT&Tag技术的四大应用场景

CUT&Tag技术的四大应用场景

  • 价 格: 电议
  • 型号:
  • 生 产 地:中国大陆
  • 访问:0次
  • 发布日期:2021/10/26(更新日期:2021/10/26)

武汉艾美捷科技有限公司

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CUT&Tag In-Place-Sequencing,用于快速富集与蛋白质结合的DNA,并绘制全基因组蛋白质/DNA相互作用图。具有“两高低”的优势:高分辨、高时效以及低输入。
  • 详细内容
  • 公司简介
 CUT&Tag是种新的DNA—蛋白质互作研究方法。与传统的ChIP-Seq相比,CUT&Tag技术操作简便,无需免疫共沉淀和超声破碎;细胞起始量低。60-100000个细胞就可以满足需要,且CUT&Tag单细胞技术已经实现;步完成建库,不需要传统的修复末端,加A,加接头构建文库;信噪比高。

 

CUT&Tag技术优势——特异性强,背景噪音较低;灵敏度强;重复性较好;成本远低于ChIP-Seq

 

CUT&Tag技术原理:

CUT&Tag技术的核心是在Tn5上融合了protein A/G抗体结合功能域的转座体pAG-Tn5。在进行CUT&Tag实验时,先进行靶蛋白特异性抗体(抗)孵育,使抗体进入细胞与靶蛋白结合。为了放大信号,同理接着进行二抗孵育。zui后孵育pAG-Tn5转座体,使得转座体进入细胞并与抗体结合,这样就把转座体间接的固定在靶蛋白上,随后加入Mg2+,激活Tn5酶的切割活性,打断靶蛋白结合的DNA区域。由于Tn5连有测序接头,在打断的同时直接在片段化的DNA上加接头,接着提取DNA,进行PCR扩增构建文库。

 

:CUT&Tag实验结果进行qPCR分析

CUT&Tag实验所获取的DNA片段可以进行qPCR以检测目的条带的富集情况。CUT&Tag-qPCRChIP-qPCR类似,定量的长度、方法、引物设计等几乎完全致。般的实验流程为:细胞与磁珠结合—抗孵育—二抗孵育—转座体孵育—片段化—DNA提取—qPCR检测。整个实验流程不超过10小时。

 

二:CUT&Tag实验结果进行高通量测序(NGS)分析

CUT&Tag本身是种高通量测序技术,zui终所获取的实验结果也是测序文库。CUT&Tag的文库与ChIP-Seq类似,都是200-1000bp左右的文库。测序所得的数据可以用常规的分析软件进行分析,无需特殊的分析软件。般的实验流程为:细胞与磁珠结合—抗孵育—二抗孵育—转座体孵育—片段化—DNA提取—PCR构建文库—文库纯化—质检—测序。整个实验流程约10小时。

 

三、CUT&Tag技术对不同的靶蛋白具有广泛的适用性

CUT&Tag与ChIP-seq样,对常见的组蛋白和转录因子具有很好的适用性。多篇引用文章证实,CUT&TagRARCCKBRTWIST2(转录因子)、JUNJUNBPIM1Runx1SOX15DNA直接或者间接结合蛋白都具有很好的适用性。即CUT&Tag技术适用于全基因组范围内的DNA-蛋白质互作研究。

 

四、CUT&Tag技术对不同的细胞样本具有广谱的适用性

CUT&Tag技术对实验室常规的模式生物和细胞系都有很好的适用性。这些模式生物包括人、动物、植物、微生物样本。CUT&Tag技术在HepG2 cellRAW246.7 cellKYSE cellHuman primary cellHuman Tissure cellhPSCsK562 cellmouse ES cellHEK293T cellmouse MEFs cellmouse embryos cellmouse brain cellNIH3T3 cellCD4+T cellHeLa S3 cellH1 hESCs cellCD8+T cell、果蝇细胞、muscle stem cell、拟南芥、水稻、棉花等细胞样本中已经得到了应用,可见,CUT&Tag技术对实验室常规细胞样本具有广谱的适用性,含有细胞壁的细胞也适用。

艾美捷 CUT&Tag技术 相关研究工具:

cat# 名称   时长

P-2028 EpiNext CUT&RUN Fast Kit  <3小时

P-9018 EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit  <3小时

P-9016 EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit  <6小时

P-2032 EpiNext cTIP (CUT&Tag In-Place)-Sequencing Kit  <5小时

 

来源:https://www.amyjet.com/featured/cutrun-3.shtml


武汉艾美捷科技有限公司(AmyJet Scientific Inc),简称艾美捷科技(AmyJet Scientific)。2010年底成立于九省通衢的湖北省武汉市,历经五年多的发展,已成为国内知名的集进口试剂、实验室耗材销售、技术服务与合约开发为一体的专业化高科技生物企业。艾美捷科技总部设在武汉市洪山区光谷大道35号光谷总部国际二期时代1号楼13层,业务覆盖全国。
 
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艾美捷科技与国内外优秀的生物试剂供应商保持着密切的合作关系,目前已成为众多国际知名品牌的中国总代理或一级代理,主要包括:Merck Millipore、Origene、AAT Bioquest、ABGENT、 Cayman Chemical、Abnova 、Biovision、ProSpec、Hycult Biotech 、Equitech-Bio、Trevigen、Alomone Labs、Epigentek、Abbkine、ImmunoReagents 、Jackson、SouthernBiotech、US Biological 、VIVA Bioscience 、Caisson Labs等,可以在第一时间为用户提供最前沿的专业资讯、完备的产品及物流服务。
 
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                                                                           办公区  
随着公司业务的壮大,为了更好的服务客户,公司组建了一支在生物领域经验丰富的研发团队-艾美捷生物技术中心,宣布进入自主研发阶段,以期将更多更优质的产品推荐给国内生物领域的同仁。相信在不久的将来,将陆续有印有艾美捷Logo的产品与大家见面,并逐渐受到大家的认可!
 
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                                                                    实验室&培训区
专业的技术力量使我们能够为广大用户提供强大的技术支持,深厚的人脉资源使我们在全国主要城市拥有众多合作伙伴,艾美捷科技非常荣幸能将世界上最先进的生物产品推荐给国内从事生物学领域科研的老师和同仁,配备的优秀销售队伍以及专业的技术支持,随时为客户提供技术咨询和售后服务。
作为专业性的产品供应公司,公司出资储备了大量现货;作为产品研发公司,公司必将不遗余力,努力向专业化、国际化标准迈进,打造科技与服务并存型企业!
诚挚邀请各位供应商、经销商、老师们莅临艾美捷科技参观、指导!
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