培养细胞一经污染，大都较难处理。假如污染细胞价值不大，宜弃之；有细胞株留存的或可购置的，可在寻找原因后彻底消毒操作室，复苏或重新购置细胞，再培养。若污染细胞价值较大，又难于重新得到，可采纳以下办法根除。
（一）运用抗生素
抗生素对杀灭细菌较有用。联合用药比单独用药作用好。防范用药比污染后再用药作用好。防范用药一般用双抗生素（青霉素100u/mL加链霉素100μg/mL），污染后根除用药需选用大于常用量5～10倍的冲洗法，于加药后作用24～48小时，再换常规培养液。
此法在污染早期或许有用。所用抗生素品种除青霉素、链霉素外，还可用庆大霉素、卡那霉素、多粘菌素、四环素、制霉菌素等。常用400～800μg/mL卡那霉素或200μg/mL四环素处理，每隔2～3日换液1次，传1～2代进行治疗。
近年来有报导，4-氟，2-羟基喹啉（Ciprofloxacin,Cip）、截耳素衍生物（Pleu-romutilinderivative,BM-Cyclin2:BM-1和四环素衍生物（BM-2）等三种抗生素单用或合用对杀灭支原体有用。
这三种抗生素均用配成250X浓缩液，-20℃保存备用，运用浓度Cip为10μg/mL，BM-1为10μg/mL，BM-2为5μg/mL。运用时先吸除污染的培养液，参与含BM-1的RPMI1640培养液，3天后再吸除培养液，参与含BM-2的RPMI1640培养液，培养4天，如此接连3个轮次，直至用33258荧光染色镜检证明已根除支原体后，再加正常培养液培养传代3-4次。
