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核酸杂交技术是较早的应用于病原微生物的检测技术。因其操作步骤比较烦琐,现在在动物检验检疫中应用较少,但是它是其他一些核酸检测技术的基础。它的基本步骤如下。
首先,制备一段寡核苷酸,其序列对应于被测病原微生物某段特异性核酸序列,在此寡核苷酸上进行适当的标记,作为检测用探针。
然后,从样品中提取核酸,对此核酸进行变性处理后固定在固相载体上,这些核酸变性处理后多数以单链的形式存在,因此它们能够利用碱基互补原理,结合并固定探针,由于借助探针上标记的物质可以了解到是否有探针,甚至有多少探针被固定上去,再由此推知样品中是否含有及甚至含有多少病原微生物。
上述是最常用的固相杂交大致过程,除此之外还有液相杂交以及用于研究的细胞内定位(原位)杂交模式。新近发展的核酸芯片技术实际上也是一类核酸杂交技术。
就固相杂交而言,又可分为斑点杂交和凝胶电泳印迹转移杂交。斑点杂交是直接将标本点在固相载体上杂交,该法迅速简单,一次可检测大量标本;凝胶电泳印迹转移杂交是电泳技术和杂交技术结合的一种方法,根据杂交核酸的不同,又可分为Southern印迹法(检测DNA)及Northern印迹法(检测RNA)。传统的固相载体多应用硝酸纤维膜和尼龙膜,近年来发展的微孔板包被技术以微孔板为载体取得了良好的效果。
探针标记物有放射性核素与非放射性物质两种。放射性核素标记敏感性高,可检测出pg水平的核酸,但因不易长期保存,且存在放射性污染等问题,现已较少应用。非放射性物质常用的有生物素、地高辛等,非放射性探针安全、稳定、操作方便并且经济,但敏感性较低,近年来,由于杂交信号检测方法的改进,检测的敏感性得到了很大提高。
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